BIOLOGIA MOLEKULARNA 2

 0    171 adatlap    chomikmimi
letöltés mp3 Nyomtatás játszik ellenőrizze magát
 
kérdés język polski válasz język polski
Białka, światło?
kezdjen tanulni
Światło o długośi 280 nm
Absorpcja gdzie najwieksza
kezdjen tanulni
dla nukleotydów
Absorpcja gdzie najmniejsza
kezdjen tanulni
dla dsDNA
Od czego zależy współczynnik ekstyncji'?
kezdjen tanulni
Od długości badanej cząsteczki
co znaczy hipochromizm
kezdjen tanulni
mniej barwny
dsDNA o stęż 1mg/ml ile a?
kezdjen tanulni
a260 = 20
RNA i ssDNA ile a?
kezdjen tanulni
a260- 25
co ma wyższy współczynnik ekstynkcji, puryny czy pirymidyny?
kezdjen tanulni
puryny
Topnienie (ogrzewanie) - absorbancja?
kezdjen tanulni
40% wzrost absorbancji
Szybkie ochładzanie - absorbancja?
kezdjen tanulni
Minimalny spadek absorbancji
Wolne ochładzanie - absorbancja?
kezdjen tanulni
Absorbancja bez zmian
Wektor, jaka zdolność
kezdjen tanulni
Zdolność do izolacji od gospodara i replikacji
Fag alfa, zdolność?
kezdjen tanulni
Zdolność do klonowania większych fragmentów
h13 zdolność?
kezdjen tanulni
zdolność do klonowanie fragmentów jednoniciowych
co to kosmid?
kezdjen tanulni
plazmid + fag alfa
Episomalne plazmidy są wektorami dla?
kezdjen tanulni
Są wektorami dla drożdzy
Plazmid Ti wektor dla?
kezdjen tanulni
Roślin
Biblioteki DNA
kezdjen tanulni
zbiory sklonowanych przypadkowo fragmentów genomu DNA/cDNA
Mapowanie restrykcyjne
kezdjen tanulni
analiza fragmentów klonu po cięciu restryktazami
Komórki kompetentne
kezdjen tanulni
są zdolne do przyjęcia obcego DNA przez działanie na nie jonami Ca2+, Mn2+, Rb2+
Transformanty, gdzie najpierw są przechowywane?
kezdjen tanulni
w płynnej pożywce z antybiotykiem (selekcja)
Gdzie po selekcji są przechowywane transformanty?
kezdjen tanulni
Są zamrażane z glicerolem (nie tworzą się kryształy), tzw. zapas glicerolowy
Co robi fosfotaza alkaliczna?
kezdjen tanulni
ten enzym usuwa reszty fosforanowe z 5'
co robi polimeraza DNA I?
kezdjen tanulni
ten enzym odpowiada za syntezez nici z 5->3
co to Fragment klenowa?
kezdjen tanulni
ten enzym to pochodna polimerazy DNA I, brak własciowsci egzonukleazy
Nukleaza fasoli mung co to
kezdjen tanulni
ten enzym trawi jednoniciowe fragmenty naprzeciw pęknięcia nici
ODWROTNA TRANSKRYPTAZA
kezdjen tanulni
Zależna od RNA, synteza DNA komplementarnego do RNA w kierunku 3->5 od startera z 3'OH
czego wymaga odwrotna transkryptaza?
kezdjen tanulni
trifosforanów deoksyrybonukelozydów
co robi RNAza A?
kezdjen tanulni
ten enzym trawi RNA
co robi RNAza H?
kezdjen tanulni
ten enzym trawi RNA hybrydy DNA-RNA
Terminalna transferaza co robi
kezdjen tanulni
ten eznym dodaje nukleotydy do końca 3' a jak GTP to powtaje ogon oligoG
A260/a280 = 1,8 a czystość dna
kezdjen tanulni
Czyste DNA
a260/280 < 1,8 a czystosc DNA
kezdjen tanulni
zanieszczone białkiem
a260/280 > 1,8 a czystosc DNA
kezdjen tanulni
zanieszczyczone RNA
co to Wirowanie izopikniczne
kezdjen tanulni
równowagowe wirowanie w gradiencie stężeń chlorku cezu
Co umożliwia wirowanie izopikniczne?
kezdjen tanulni
Umożliwia analizę DNA i jego oczyszczanie
Gęstość DNA w wirowaniu izopiknicznym?
kezdjen tanulni
1,7g/cm3
Co robi RNA i białka w wirowaniu izopiknicznym?
kezdjen tanulni
RNA w dół, białka flotują(unoszą się)
Jaki barwnik w elektroforezie?
kezdjen tanulni
różowo/pomarańczowy bromek etydyyny
jak zachodzi elektroforeza
kezdjen tanulni
od KATODY (-) do ANODY (+)
Od czego zależy szybkość migracji kolistego DNA w elektroforezie?
kezdjen tanulni
od warunków
Napięcie w elektroforezie
kezdjen tanulni
5-8 V/cm3
Gdzie najlepiej widoczna elektroforeza?
kezdjen tanulni
w RNA
Jakie środowisko zachodzenia elektroforezy?
kezdjen tanulni
W żelu agarozowym (bromek etydyny) lub poliakrydynowym (AgNO3/SYBR)
co to metoda gRTPCR?
kezdjen tanulni
real time, analiza ilości produktów w czasie rzeczywistym
czego używa się w gRTPCR?
kezdjen tanulni
SYBR
cechy SYBR
kezdjen tanulni
nietoksyczny i silnie wiążacy DNA
Kiedy zachodzi analiza w gRTPCR?
kezdjen tanulni
analiza w czasie trawienia
czego analiza w gRTPCR?
kezdjen tanulni
Analiza polimorfizmu pojedynczych nukleotydów
Co jest znakowane w gRTPCR?
kezdjen tanulni
nukleotydy i sondy
Elektroforeza mikrokapilarna
kezdjen tanulni
z wykorzystaniem macierzy
Elektroforeza kapilarna
kezdjen tanulni
w wolnym buforze, niewielkie cząsteczki, z cienkiej kapilarze kwarcowej
W żelu poliakrydynowym elektoforeza (PZ)
kezdjen tanulni
5-1000 pz (gRTPCR)
w żelu agarozowym elektroforeza
kezdjen tanulni
0,1 - 20 kpz
w polu pulsacyjnym elektroforeza
kezdjen tanulni
20kpz - 10 Mpz, oddziela cząsteczki wielkości 100kpz
Choroba takahary, inna nazwa
kezdjen tanulni
alaktazemia
jaki gen, choroba Takahary?
kezdjen tanulni
Gen kontrolujący syntezę katalazy, krótkie ramie chromosomu 11 (11p13)
jak dziedziczona alaktazemia?
kezdjen tanulni
autosomalnie recesywnie
Na czym polega alaktazemia?
kezdjen tanulni
Redukcja aktywnośći katalazy
gdzie najczęściej alaktazemia?
kezdjen tanulni
Najwyższa częstość występowania mutacji w Japonii
Objawy alaktazemii
kezdjen tanulni
Owrzodzenie śluzówek jamy ustnej, podudzi, oraz wczesne wypadanie zębów
Cholinoesteraza
kezdjen tanulni
gen na 3 chromosomie i tam mutacja
Wrażliwość na chlorek suksametonium, objawy?
kezdjen tanulni
zwiotczenie mięśni, efekt szybki ale też szybko zanika. (za objawy odpowiada hydroliza sukcynylocholiny)
za hydrolizę sukcynylocholiny odpowiedzialna jest?
kezdjen tanulni
cholinoesteraza
Jak dziedziczona hipertermia złośliwa?
kezdjen tanulni
autosomalnie dominująco
Przez co wywoływana hipertermia złośliwa
kezdjen tanulni
leki znieczulenia ogólnego: antystetyki wziewne, dożylne, leki zwiotczające, glikozydy naprastnicy
Objawy hipertemia złośliwa
kezdjen tanulni
wzrasta napięcie mięsni prązkowanych, drzenie mięsniowe, pojawa się tachykardia i wzrost temperatury ciała(1 stopien w ciagu 5 min)
Mutacja genu 19q13.1
kezdjen tanulni
Koduje receptor rianodynowy uwalniajacy wapń z retikulum do cytoplazmy ->hipertermia złośliwa
Jak dziedziczona hipertermia złośliwa?
kezdjen tanulni
autosomalnie dominująco
Alaktazemia jaki gen
kezdjen tanulni
11p13
jak dziedziczona alaktazemia?
kezdjen tanulni
autosomalna recesywna
Metaboizm alkoholu etylowego, jakie enzymy?
kezdjen tanulni
Dehydrogenaza alkoholowa ADH i dehydrogenaza aldehydowa ALDH
gdzie dehydrogenaza alkoholowa ADH?
kezdjen tanulni
chromosom 4
gdzie dehydrogenaza aldehydowa ALDH?
kezdjen tanulni
1-chromosom 9, 2-chromosom 12
Porifiryny
kezdjen tanulni
prekursory hemu i składniki enzymów
na jakie dzielimy porifiryny
kezdjen tanulni
na wątrobowe i erytropoetyczne
Porfirie, na czym polega
kezdjen tanulni
Deficyt enzymów biorących udział w przemianach porfiryn
Jak dziedziczone porfirie?
kezdjen tanulni
Autosomalnie dominująco
Krzywica odporna na wit D3, jaki gen?
kezdjen tanulni
gen VDR dominująco w sprzężeniu z chromosomem X
Niedobór dehydrogenaza glukozo-6-fosforanowej, jaki chromosom
kezdjen tanulni
chromosom X
niedobór alfa-1-antytrypsyny, jaki gen i chromosom
kezdjen tanulni
Gen PI, chromosom 14
niedobór paraoksonazy, gen + chromosm
kezdjen tanulni
gen PON1 na chromosomie 7 sprzeżony z genem CFTR
Hemochromatoza, jaki gen
kezdjen tanulni
gen HFE na chromosomie 6, autosomalnie recesywnie
hipolaktazja, jaki gen
kezdjen tanulni
3 allele na chromosomie 3
fenyloketonuria, jaki gen
kezdjen tanulni
12q24.1
Jak dziedziczona fenyloketonuria?
kezdjen tanulni
autosomalnie recesywnie
Co wywołuje ostrą porfirie?
kezdjen tanulni
Lek, infekcje, głodzenie, duży wysiłek fizycnzy
Jakie leki wywołują ostrą porfifrie?
kezdjen tanulni
barbiturany, sulfonamidy, przeciwbólowe, antykoncepcyjne, antybiotyki, alkaloidy sporyszu, etanolu,
Kiedy forma enolowa?
kezdjen tanulni
w pH zasadowym
Kiedy forma ketonowa?
kezdjen tanulni
w ph obojętnym
Co to sonikacja?
kezdjen tanulni
Działanie ultradźwiękiem o dużej intensywności na DNA
Do czego prowadzi sonikacja?
kezdjen tanulni
Do uszkodzenia DNA i zmniejszenia jego lepkośći
Podział zasad
kezdjen tanulni
Puryny i pirymidyny
Puryny
kezdjen tanulni
adenina i guanina (2 pierścienie)
Pirymidyny
kezdjen tanulni
cytozyna, tymina, uracyl (1 pierścien)
Co to liza alkaliczna?
kezdjen tanulni
Metoda oczyszczania plazmidowego DNA z chromosowego DNA i innych
Plazmidy
kezdjen tanulni
Autonomiczne, pozachromosome elementy genetyczne
W jakiej postaci występują Plazmidy?
kezdjen tanulni
w postaci kolistych/liniowych cząsteczek DNA
gdzie wystąpują Plazmidy?
kezdjen tanulni
u prokariotów i niektórych eukariotów
Jaka zdolnosc maja plazmidy?
kezdjen tanulni
Zdolność do trwałego utrzymywania się i replikowania w komórce
Plazmidy a chromosomy gospodarza
kezdjen tanulni
Są odrębne od chromosomów gospodrza
Jaką struktuę tworzą plazmidy?
kezdjen tanulni
CCC-DNA
co robi CCC-DNA?
kezdjen tanulni
wykazuje negatywne superskręcenie
Jakie plazmidy nie tworzą struktury CCC-DNA?
kezdjen tanulni
Plazmidy izolowane z hypertermofilnych Archaea, u których jest pozytywne superskręcenie cz. DNA
wielkość plazmidów
kezdjen tanulni
od 1000 pz do 1,7 Mpz
Gdzie najmniejsze plazmidy?
kezdjen tanulni
U Heamophilus somnus, Mycoplasma i Helicobacter pylori
Gdzie największe plazmidy?
kezdjen tanulni
u Rhizobium
Gen kodujący białko (plazmidy)
kezdjen tanulni
30 kDa - 1 kpzC
Co zawierają plazmidy?
kezdjen tanulni
Region początku replikacji
Jakie geny często zawierają plazmidy?
kezdjen tanulni
odporności, np. gen bla / ampr
Co robi gen bla/ampr?
kezdjen tanulni
Koduje beta-laktamaze, która rozkłada antybiotyki penicylowe
NORTHERN BLOT
kezdjen tanulni
dla transferu rozdzielonego elektroforetycznie DNA
SOUTHERNBLOT
kezdjen tanulni
osmoza do wymuszenia węrdrówki soli z pociąganiem DNA ze sobą
WESTERN BLOT
kezdjen tanulni
dla transferu białka
EASTERN BLOT
kezdjen tanulni
dla transferu białek po ich rozdziale w elektroforezie dwukierunkowej
DNA/RNA w środowisku kwasowym
kezdjen tanulni
hydroliza
DNA/RNA w środowisku lżej kwasowym (3-4)
kezdjen tanulni
hydroliza wiązan glikozydowych, kwas apurynowy
DNA/RNA w środowisku zasadowym
kezdjen tanulni
denaturacja (RNA i DNA), hydroliza (RNA, bo ma 2-OH')
Co jest bardziej podatne na hydrolize? DNA czy RNA?
kezdjen tanulni
ZAWSZE RNA
Multipleks PCR
kezdjen tanulni
ampliflikacja równoczesna
Nested-PCR
kezdjen tanulni
wewnętrzna/gniazdowa, gdy mało matryc
RT-PCR
kezdjen tanulni
przepisanie sekwencji z MRNA składającego się z samych eksonów na cDNA - stwierdzanie obecności określonych transkryptów
STS-PCR
kezdjen tanulni
Umożliwia indentyfikację poszczególnych loci dzięki amplifikacji fragmentu DNA pomiędzy parą starterów o znanej sekwencji
STS – ile pz?
kezdjen tanulni
200-300 pz
Zagęszczanie map genetycznych, jaka metoda
kezdjen tanulni
STS-PCR
Poszukiwanie sprzężen z cechami genotypowymi, jaka metoda
kezdjen tanulni
STS-PCR
do uporządkowania bibiloteki genomowej w KONTIGI, jaka metoda?
kezdjen tanulni
STS-PCR
RACE-PCR
kezdjen tanulni
szybka amplifikacja końców Cdna, poznanie dokładnej sekwencji jednego z końców
ASA=PASA=ASP=ARMS
kezdjen tanulni
amplifikacja alleo-specyficzna, wykrywa polimorfizm alleli i mutacji punktowych
ASO
kezdjen tanulni
połączenie hybrydyzacji i PCR
co robi sonda w ASO?
kezdjen tanulni
sonda rozponzacje allel prawidłowy/zmutowany
OLA
kezdjen tanulni
badanie ligacji oligonukleotydów, połączenie PCR i ligacji DNA
REP-PCR
kezdjen tanulni
wykorzystanie sekwencji repetytywnych
AS-PCR
kezdjen tanulni
asymetryczne PCR, amplifikowana tylko 1 nić, na 3' fluorochrom
I-PCR
kezdjen tanulni
odwrócona PCR, DNA oskrzydla znana sekwencje
PCR in situ
kezdjen tanulni
z udziałem znakowanych nukleotydów, czuła i kosztowna
RAPD-PCR
kezdjen tanulni
losowa amplifikacja polimorficznego DNA, umożliwia jednoczesną detekcję polimorfizmu wielu loci w całym genomie
Jaka ilość DNA wyjściowego w RAPD-PCr?
kezdjen tanulni
mała
W jakiej metodzie PCR wykyrywane loci mają dominujący charakter?
kezdjen tanulni
w RAPD-PCR
W jakiej metodzie nie można odróżnić homozygot od heterozygot?
kezdjen tanulni
w RAPD-PCR, bo wizualizacja tylko jednego z dwóch alleli
Badanie jakiego materiału jest zalecane przy RAPD-PCR?
kezdjen tanulni
Haploidalnego materiału
W jakiej metodzie badanie zróżnicowania DNA jądrowego między osobnikami i populacjami?
kezdjen tanulni
RAPD-PCR
Jaka metoda umożliwia szybkie określenie liczby chromatyny X i Y w jądrach interfazowych?
kezdjen tanulni
FISH
FISH umożliwia zlokalizowanie jakich sekwencji DNA?
kezdjen tanulni
nieswoistych sekwencji DNA bezporśrednio w materiale genetycznym
Jakie zmiany bada FISH?
kezdjen tanulni
Zmiany ilościowe w liczbie i strukturze chromosomów
Metoda oparta na fish
kezdjen tanulni
cytogenetyka interfazalna
Do czego hybrydyzacja typu northern?
kezdjen tanulni
do analizy RNA i procesu transkrypcji poszczególnych genów
Ustalanie, które geny uległy transkrypcji w badanych tkankach - jaka metoda
kezdjen tanulni
Hybrydyzacja typu northern
Ustalanie, które geny uległy transkrypcji na danym etapie rozwoju - jaka metoda?
kezdjen tanulni
hybrydyzacja typu northern
Poznanie czego jest możliwe dzięki hybrydzacji typu northern?
kezdjen tanulni
Poznanie długości RNA i intensywność jego transkrybcji
Hybrydyzacja RNA-DNA jaka metoda
kezdjen tanulni
northern
Hybrydyzacja DNA-DNA jaka metoda
kezdjen tanulni
southern
HGP
kezdjen tanulni
projekt poznania ludzkiego genomu
knockout
kezdjen tanulni
pozbawienie zwierzęcia doświadczalnego określonego typu
genomika porównawcza
kezdjen tanulni
porównawcza analiza różnych genotypów
proteomika
kezdjen tanulni
wiedza o zespolach bialek wytwarzanych przez komórki, tkanki, narządy
transkryptomika
kezdjen tanulni
badanie regulacji ekspresji genów na poziome transkrypcji
gdzie znalezione enzymy restrykcyjne?
kezdjen tanulni
jedynie w komórkach bakterii i sinic
Enzym restrykcyjny jakie sekwencje rozpoznaje?
kezdjen tanulni
Speficzyne sekwencje dwuniciowego DNA o długości 4-8 par zasad
Aktywność STAR
kezdjen tanulni
niespecyficznośćenzymów restrykcyjnych w niektórych warunkach
kiedy aktywność star?
kezdjen tanulni
kiedy trawienie przeprowadza sięwinnych warunkach niż optymalnie
Enzym EcoRI a zmienione warunki
kezdjen tanulni
zmienione warunki mogę uniemożliwić wykrycie struktury GAATTC, którą normalnie rozpoznaje
co to optymalne warunki trawienia
kezdjen tanulni
odpowiednie Ph, stęzenie jonów magnezu
Co pozostawiją enzymy restrykcyjne?
kezdjen tanulni
Końce tępe i lepkie w cząsteczce
Gdy obie nici rozcięte są naprzeciwko siebie równolegle, powstają
kezdjen tanulni
tępe końce
Gdy jednoniciowe sekwencje wystepujace na obu koncach sa przeciete niesymetrycznie, powstaja
kezdjen tanulni
lepkie konce
Restryktazy czworkowe
kezdjen tanulni
rozpoznaja sekwencje DNA co 256pz
Restryktazy szostkowe
kezdjen tanulni
Rozpoznaja sekwencje DNA co 4096 pz
Izoschizomery
kezdjen tanulni
enzymy pochodzące z różnych szczepów bakterii, ale rozpoznające te same sekwencje DNA
Egzonukleazy
kezdjen tanulni
umożliwiaja odpowiednią modyfikacje koncow we fragmentach DNA
polimerazy
kezdjen tanulni
odpowiedzialne za amplifikację odpowiednich odcinkow DNA

Kommentár közzétételéhez be kell jelentkeznie.